Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rin3P59729 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rin3P59729 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rin3P59729 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rin3P59729 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rin3P59729 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms