Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms