Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P58686 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P58686 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P58686 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P58686 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
P58686 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P58686 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P58686 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P58686 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P58686 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P58686 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P58686 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P58686 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P58686 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P58686 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
P58686 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P58686 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P58686 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
P58686 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P58686 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P58686 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P58686 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P58686 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P58686 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P58686 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P58686 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P58686 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P58686 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P58686 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P58686 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P58686 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P58686 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P58686 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P58686 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P58686 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
P58686 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
P58686 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P58686 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P58686 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P58686 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P58686 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P58686 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P58686 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P58686 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P58686 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P58686 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P58686 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P58686 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P58686 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P58686 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P58686 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P58686 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P58686 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P58686 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P58686 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P58686 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P58686 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P58686 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P58686 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
P58686 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
P58686 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
P58686 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
P58686 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P58686 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P58686 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P58686 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P58686 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P58686 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P58686 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P58686 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P58686 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P58686 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P58686 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P58686 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P58686 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P58686 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P58686 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P58686 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P58686 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P58686 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P58686 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P58686 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P58686 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P58686 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P58686 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P58686 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P58686 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P58686 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P58686 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P58686 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P58686 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P58686 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P58686 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P58686 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P58686 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P58686 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P58686 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P58686 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P58686 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P58686 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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