Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sh3bp1P55194 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms