Protein–RNA interactions for Protein: P55144

Tyro3, Tyrosine-protein kinase receptor TYRO3, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tyro3P55144 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tyro3P55144 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tyro3P55144 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tyro3P55144 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tyro3P55144 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tyro3P55144 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tyro3P55144 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tyro3P55144 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms