Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Aqp4P55088 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Aqp4P55088 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Aqp4P55088 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Aqp4P55088 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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