Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PctpP53808 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PctpP53808 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PctpP53808 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PctpP53808 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PctpP53808 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PctpP53808 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PctpP53808 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PctpP53808 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PctpP53808 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PctpP53808 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PctpP53808 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PctpP53808 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PctpP53808 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PctpP53808 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PctpP53808 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PctpP53808 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PctpP53808 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PctpP53808 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PctpP53808 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PctpP53808 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PctpP53808 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PctpP53808 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PctpP53808 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PctpP53808 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PctpP53808 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PctpP53808 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PctpP53808 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PctpP53808 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PctpP53808 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PctpP53808 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PctpP53808 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PctpP53808 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PctpP53808 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PctpP53808 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PctpP53808 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PctpP53808 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PctpP53808 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PctpP53808 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PctpP53808 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PctpP53808 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PctpP53808 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PctpP53808 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PctpP53808 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PctpP53808 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PctpP53808 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PctpP53808 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PctpP53808 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PctpP53808 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PctpP53808 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PctpP53808 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PctpP53808 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PctpP53808 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PctpP53808 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PctpP53808 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PctpP53808 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PctpP53808 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PctpP53808 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PctpP53808 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PctpP53808 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PctpP53808 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PctpP53808 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PctpP53808 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PctpP53808 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PctpP53808 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PctpP53808 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PctpP53808 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PctpP53808 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PctpP53808 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PctpP53808 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PctpP53808 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PctpP53808 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PctpP53808 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PctpP53808 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PctpP53808 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PctpP53808 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PctpP53808 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PctpP53808 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PctpP53808 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PctpP53808 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PctpP53808 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PctpP53808 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PctpP53808 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PctpP53808 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PctpP53808 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PctpP53808 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PctpP53808 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PctpP53808 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PctpP53808 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PctpP53808 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PctpP53808 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PctpP53808 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PctpP53808 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PctpP53808 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PctpP53808 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PctpP53808 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PctpP53808 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PctpP53808 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PctpP53808 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PctpP53808 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms