Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cux1P53564 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cux1P53564 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Cux1P53564 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cux1P53564 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cux1P53564 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Cux1P53564 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Cux1P53564 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cux1P53564 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cux1P53564 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cux1P53564 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cux1P53564 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cux1P53564 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms