Protein–RNA interactions for Protein: P50586

Tub, Tubby protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TubP50586 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TubP50586 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TubP50586 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TubP50586 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TubP50586 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TubP50586 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TubP50586 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TubP50586 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TubP50586 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TubP50586 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TubP50586 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TubP50586 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TubP50586 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TubP50586 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TubP50586 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TubP50586 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TubP50586 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TubP50586 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TubP50586 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TubP50586 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TubP50586 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
TubP50586 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TubP50586 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TubP50586 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TubP50586 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TubP50586 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TubP50586 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TubP50586 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TubP50586 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TubP50586 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TubP50586 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TubP50586 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TubP50586 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TubP50586 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TubP50586 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TubP50586 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TubP50586 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TubP50586 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TubP50586 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TubP50586 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TubP50586 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TubP50586 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TubP50586 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TubP50586 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TubP50586 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TubP50586 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TubP50586 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TubP50586 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TubP50586 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TubP50586 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TubP50586 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TubP50586 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TubP50586 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TubP50586 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TubP50586 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TubP50586 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TubP50586 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TubP50586 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TubP50586 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TubP50586 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TubP50586 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TubP50586 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TubP50586 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TubP50586 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TubP50586 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TubP50586 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TubP50586 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TubP50586 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TubP50586 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TubP50586 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TubP50586 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TubP50586 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TubP50586 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TubP50586 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TubP50586 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TubP50586 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TubP50586 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TubP50586 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TubP50586 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TubP50586 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TubP50586 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TubP50586 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TubP50586 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TubP50586 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TubP50586 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TubP50586 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TubP50586 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TubP50586 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TubP50586 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TubP50586 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TubP50586 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TubP50586 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TubP50586 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TubP50586 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TubP50586 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TubP50586 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TubP50586 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TubP50586 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TubP50586 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TubP50586 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms