Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

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Length 737 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prox1P48437 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prox1P48437 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prox1P48437 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Prox1P48437 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prox1P48437 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prox1P48437 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prox1P48437 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prox1P48437 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prox1P48437 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prox1P48437 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prox1P48437 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prox1P48437 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Prox1P48437 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prox1P48437 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prox1P48437 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prox1P48437 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prox1P48437 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prox1P48437 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prox1P48437 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prox1P48437 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prox1P48437 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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