Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TgfaP48030 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TgfaP48030 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms