Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf1P46099 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf1P46099 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf1P46099 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf1P46099 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf1P46099 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf1P46099 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf1P46099 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klf1P46099 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klf1P46099 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klf1P46099 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf1P46099 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf1P46099 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf1P46099 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf1P46099 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms