Protein–RNA interactions for Protein: P41971

Elk3, ETS domain-containing protein Elk-3, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk3P41971 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elk3P41971 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elk3P41971 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms