Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl28P41105 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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