Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprkP35822 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprkP35822 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprkP35822 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PtprkP35822 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PtprkP35822 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PtprkP35822 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprkP35822 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprkP35822 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprkP35822 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprkP35822 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 189.2 ms