Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptk2P34152 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms