Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdk4P30285 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms