Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxd10P28359 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms