Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChgaP26339 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChgaP26339 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ChgaP26339 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChgaP26339 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChgaP26339 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ChgaP26339 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms