Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZfaP23607 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZfaP23607 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZfaP23607 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZfaP23607 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZfaP23607 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZfaP23607 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZfaP23607 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZfaP23607 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZfaP23607 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZfaP23607 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZfaP23607 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZfaP23607 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZfaP23607 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZfaP23607 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZfaP23607 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZfaP23607 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZfaP23607 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZfaP23607 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZfaP23607 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZfaP23607 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZfaP23607 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZfaP23607 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZfaP23607 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZfaP23607 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZfaP23607 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZfaP23607 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZfaP23607 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZfaP23607 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZfaP23607 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms