Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Ggta1P23336 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Ggta1P23336 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Ggta1P23336 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Ggta1P23336 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ggta1P23336 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ggta1P23336 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Ggta1P23336 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ggta1P23336 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ggta1P23336 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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