Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NelfeP19426 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NelfeP19426 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NelfeP19426 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NelfeP19426 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NelfeP19426 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NelfeP19426 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NelfeP19426 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NelfeP19426 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NelfeP19426 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NelfeP19426 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NelfeP19426 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NelfeP19426 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NelfeP19426 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NelfeP19426 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NelfeP19426 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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NelfeP19426 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NelfeP19426 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NelfeP19426 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NelfeP19426 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NelfeP19426 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NelfeP19426 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NelfeP19426 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NelfeP19426 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NelfeP19426 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NelfeP19426 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NelfeP19426 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NelfeP19426 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NelfeP19426 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NelfeP19426 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NelfeP19426 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NelfeP19426 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NelfeP19426 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NelfeP19426 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NelfeP19426 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NelfeP19426 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NelfeP19426 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NelfeP19426 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NelfeP19426 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NelfeP19426 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NelfeP19426 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NelfeP19426 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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NelfeP19426 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NelfeP19426 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NelfeP19426 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NelfeP19426 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NelfeP19426 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NelfeP19426 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NelfeP19426 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NelfeP19426 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NelfeP19426 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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NelfeP19426 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NelfeP19426 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NelfeP19426 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NelfeP19426 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NelfeP19426 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NelfeP19426 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NelfeP19426 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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NelfeP19426 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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NelfeP19426 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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NelfeP19426 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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NelfeP19426 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NelfeP19426 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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