Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18524 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18524 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18524 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18524 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18524 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18524 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18524 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18524 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18524 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18524 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18524 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18524 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18524 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
P18524 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
P18524 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18524 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18524 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
P18524 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18524 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
P18524 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18524 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18524 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18524 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18524 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
P18524 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
P18524 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
P18524 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
P18524 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
P18524 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
P18524 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18524 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18524 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18524 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18524 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18524 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18524 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18524 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18524 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18524 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18524 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
P18524 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18524 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18524 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18524 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
P18524 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18524 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18524 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
P18524 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18524 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18524 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18524 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18524 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18524 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18524 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
P18524 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18524 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18524 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18524 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18524 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18524 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18524 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18524 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18524 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18524 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18524 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18524 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18524 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18524 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18524 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18524 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18524 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18524 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18524 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18524 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18524 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
P18524 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18524 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18524 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18524 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18524 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18524 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18524 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18524 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18524 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18524 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18524 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18524 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18524 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18524 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18524 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18524 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18524 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18524 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18524 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18524 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18524 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18524 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18524 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18524 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms