Protein–RNA interactions for Protein: P16014

Chgb, Secretogranin-1, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgbP16014 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChgbP16014 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChgbP16014 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ChgbP16014 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChgbP16014 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChgbP16014 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChgbP16014 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ChgbP16014 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms