Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rag1P15919 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Rag1P15919 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rag1P15919 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rag1P15919 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rag1P15919 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rag1P15919 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rag1P15919 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rag1P15919 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rag1P15919 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms