Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa1P11477 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa1P11477 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa1P11477 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa1P11477 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa1P11477 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms