Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lamp1P11438 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lamp1P11438 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lamp1P11438 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lamp1P11438 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lamp1P11438 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Lamp1P11438 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lamp1P11438 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lamp1P11438 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lamp1P11438 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lamp1P11438 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms