Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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