Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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H2-Ab1P01921 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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H2-Ab1P01921 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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H2-Ab1P01921 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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H2-Ab1P01921 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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H2-Ab1P01921 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Ab1P01921 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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