Protein–RNA interactions for Protein: P01843

Ig lambda-1 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01843 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01843 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01843 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01843 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P01843 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01843 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01843 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01843 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01843 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01843 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P01843 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01843 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01843 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01843 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01843 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01843 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01843 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01843 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01843 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01843 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01843 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01843 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01843 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
P01843 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P01843 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P01843 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P01843 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
P01843 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
P01843 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P01843 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P01843 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
P01843 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P01843 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01843 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01843 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01843 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01843 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01843 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01843 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01843 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01843 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01843 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01843 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01843 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01843 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01843 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01843 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01843 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01843 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01843 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01843 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01843 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01843 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01843 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01843 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01843 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01843 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01843 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01843 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01843 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01843 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01843 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01843 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01843 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01843 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01843 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01843 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01843 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01843 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01843 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01843 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01843 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01843 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01843 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01843 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01843 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01843 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01843 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01843 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01843 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01843 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01843 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01843 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01843 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01843 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01843 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01843 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01843 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01843 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01843 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01843 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01843 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01843 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01843 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01843 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01843 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01843 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01843 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01843 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01843 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms