Protein–RNA interactions for Protein: O88958

Gnpda1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda1O88958 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnpda1O88958 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnpda1O88958 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnpda1O88958 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnpda1O88958 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnpda1O88958 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnpda1O88958 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnpda1O88958 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnpda1O88958 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnpda1O88958 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnpda1O88958 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnpda1O88958 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnpda1O88958 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnpda1O88958 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnpda1O88958 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnpda1O88958 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnpda1O88958 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnpda1O88958 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gnpda1O88958 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnpda1O88958 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnpda1O88958 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnpda1O88958 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnpda1O88958 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnpda1O88958 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnpda1O88958 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnpda1O88958 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnpda1O88958 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnpda1O88958 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnpda1O88958 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnpda1O88958 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnpda1O88958 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnpda1O88958 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnpda1O88958 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnpda1O88958 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnpda1O88958 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnpda1O88958 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnpda1O88958 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gnpda1O88958 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gnpda1O88958 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms