Protein–RNA interactions for Protein: O88632

Sema3f, Semaphorin-3F, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3fO88632 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sema3fO88632 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema3fO88632 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema3fO88632 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema3fO88632 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema3fO88632 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema3fO88632 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema3fO88632 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema3fO88632 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema3fO88632 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema3fO88632 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema3fO88632 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema3fO88632 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema3fO88632 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema3fO88632 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema3fO88632 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema3fO88632 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema3fO88632 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms