Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ldb2O55203 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms