Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms