Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ccr6O54689 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccr6O54689 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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