Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl25O35903 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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