Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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