Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms