Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra2O08842 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra2O08842 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms