Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm11236J3QMS7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm11236J3QMS7 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms