Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn20G5E8X0 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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