Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LctF8VPT3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LctF8VPT3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms