Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms