Protein–RNA interactions for Protein: E9PWI3

Mcc, Mutated in colorectal cancers, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MccE9PWI3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MccE9PWI3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MccE9PWI3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MccE9PWI3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MccE9PWI3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MccE9PWI3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MccE9PWI3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
MccE9PWI3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MccE9PWI3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MccE9PWI3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MccE9PWI3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MccE9PWI3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MccE9PWI3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MccE9PWI3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MccE9PWI3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MccE9PWI3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MccE9PWI3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MccE9PWI3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MccE9PWI3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MccE9PWI3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MccE9PWI3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MccE9PWI3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MccE9PWI3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MccE9PWI3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MccE9PWI3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MccE9PWI3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
MccE9PWI3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
MccE9PWI3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MccE9PWI3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MccE9PWI3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms