Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav12-2A0N8N6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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