Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W9

Gria3, Glutamate receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria3Q9Z2W9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gria3Q9Z2W9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gria3Q9Z2W9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gria3Q9Z2W9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gria3Q9Z2W9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gria3Q9Z2W9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gria3Q9Z2W9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gria3Q9Z2W9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gria3Q9Z2W9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gria3Q9Z2W9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gria3Q9Z2W9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gria3Q9Z2W9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gria3Q9Z2W9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gria3Q9Z2W9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gria3Q9Z2W9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gria3Q9Z2W9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gria3Q9Z2W9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gria3Q9Z2W9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gria3Q9Z2W9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gria3Q9Z2W9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gria3Q9Z2W9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gria3Q9Z2W9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gria3Q9Z2W9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gria3Q9Z2W9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gria3Q9Z2W9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gria3Q9Z2W9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gria3Q9Z2W9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gria3Q9Z2W9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gria3Q9Z2W9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gria3Q9Z2W9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gria3Q9Z2W9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gria3Q9Z2W9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gria3Q9Z2W9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gria3Q9Z2W9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gria3Q9Z2W9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gria3Q9Z2W9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gria3Q9Z2W9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gria3Q9Z2W9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gria3Q9Z2W9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gria3Q9Z2W9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gria3Q9Z2W9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gria3Q9Z2W9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gria3Q9Z2W9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gria3Q9Z2W9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gria3Q9Z2W9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gria3Q9Z2W9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gria3Q9Z2W9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gria3Q9Z2W9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gria3Q9Z2W9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gria3Q9Z2W9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gria3Q9Z2W9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gria3Q9Z2W9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gria3Q9Z2W9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gria3Q9Z2W9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gria3Q9Z2W9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gria3Q9Z2W9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gria3Q9Z2W9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gria3Q9Z2W9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gria3Q9Z2W9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gria3Q9Z2W9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gria3Q9Z2W9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gria3Q9Z2W9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gria3Q9Z2W9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gria3Q9Z2W9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gria3Q9Z2W9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gria3Q9Z2W9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gria3Q9Z2W9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gria3Q9Z2W9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gria3Q9Z2W9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gria3Q9Z2W9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gria3Q9Z2W9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gria3Q9Z2W9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gria3Q9Z2W9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gria3Q9Z2W9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gria3Q9Z2W9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gria3Q9Z2W9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gria3Q9Z2W9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gria3Q9Z2W9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Gria3Q9Z2W9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gria3Q9Z2W9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gria3Q9Z2W9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gria3Q9Z2W9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gria3Q9Z2W9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gria3Q9Z2W9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gria3Q9Z2W9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gria3Q9Z2W9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gria3Q9Z2W9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gria3Q9Z2W9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gria3Q9Z2W9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gria3Q9Z2W9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gria3Q9Z2W9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gria3Q9Z2W9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gria3Q9Z2W9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gria3Q9Z2W9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gria3Q9Z2W9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gria3Q9Z2W9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gria3Q9Z2W9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gria3Q9Z2W9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gria3Q9Z2W9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gria3Q9Z2W9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms