Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J6

Ptgdr2, Prostaglandin D2 receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptgdr2Q9Z2J6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ptgdr2Q9Z2J6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ptgdr2Q9Z2J6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptgdr2Q9Z2J6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptgdr2Q9Z2J6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptgdr2Q9Z2J6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptgdr2Q9Z2J6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptgdr2Q9Z2J6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ptgdr2Q9Z2J6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ptgdr2Q9Z2J6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ptgdr2Q9Z2J6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ptgdr2Q9Z2J6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ptgdr2Q9Z2J6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ptgdr2Q9Z2J6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ptgdr2Q9Z2J6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ptgdr2Q9Z2J6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ptgdr2Q9Z2J6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptgdr2Q9Z2J6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptgdr2Q9Z2J6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptgdr2Q9Z2J6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptgdr2Q9Z2J6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptgdr2Q9Z2J6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptgdr2Q9Z2J6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptgdr2Q9Z2J6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ptgdr2Q9Z2J6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ptgdr2Q9Z2J6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ptgdr2Q9Z2J6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ptgdr2Q9Z2J6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ptgdr2Q9Z2J6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ptgdr2Q9Z2J6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ptgdr2Q9Z2J6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ptgdr2Q9Z2J6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ptgdr2Q9Z2J6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptgdr2Q9Z2J6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptgdr2Q9Z2J6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptgdr2Q9Z2J6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptgdr2Q9Z2J6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptgdr2Q9Z2J6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ptgdr2Q9Z2J6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ptgdr2Q9Z2J6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ptgdr2Q9Z2J6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ptgdr2Q9Z2J6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptgdr2Q9Z2J6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptgdr2Q9Z2J6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptgdr2Q9Z2J6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptgdr2Q9Z2J6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptgdr2Q9Z2J6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ptgdr2Q9Z2J6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ptgdr2Q9Z2J6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ptgdr2Q9Z2J6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ptgdr2Q9Z2J6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ptgdr2Q9Z2J6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ptgdr2Q9Z2J6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ptgdr2Q9Z2J6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptgdr2Q9Z2J6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptgdr2Q9Z2J6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptgdr2Q9Z2J6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptgdr2Q9Z2J6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptgdr2Q9Z2J6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ptgdr2Q9Z2J6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ptgdr2Q9Z2J6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ptgdr2Q9Z2J6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ptgdr2Q9Z2J6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ptgdr2Q9Z2J6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ptgdr2Q9Z2J6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ptgdr2Q9Z2J6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ptgdr2Q9Z2J6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ptgdr2Q9Z2J6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ptgdr2Q9Z2J6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ptgdr2Q9Z2J6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ptgdr2Q9Z2J6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ptgdr2Q9Z2J6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ptgdr2Q9Z2J6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ptgdr2Q9Z2J6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ptgdr2Q9Z2J6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ptgdr2Q9Z2J6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ptgdr2Q9Z2J6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ptgdr2Q9Z2J6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ptgdr2Q9Z2J6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptgdr2Q9Z2J6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptgdr2Q9Z2J6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ptgdr2Q9Z2J6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.7 ms