Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mbd1Q9Z2E2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mbd1Q9Z2E2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mbd1Q9Z2E2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mbd1Q9Z2E2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mbd1Q9Z2E2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mbd1Q9Z2E2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mbd1Q9Z2E2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mbd1Q9Z2E2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Mbd1Q9Z2E2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mbd1Q9Z2E2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mbd1Q9Z2E2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mbd1Q9Z2E2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mbd1Q9Z2E2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mbd1Q9Z2E2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mbd1Q9Z2E2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mbd1Q9Z2E2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mbd1Q9Z2E2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mbd1Q9Z2E2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mbd1Q9Z2E2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mbd1Q9Z2E2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mbd1Q9Z2E2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mbd1Q9Z2E2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mbd1Q9Z2E2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mbd1Q9Z2E2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mbd1Q9Z2E2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mbd1Q9Z2E2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Mbd1Q9Z2E2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mbd1Q9Z2E2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mbd1Q9Z2E2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mbd1Q9Z2E2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mbd1Q9Z2E2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mbd1Q9Z2E2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mbd1Q9Z2E2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mbd1Q9Z2E2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mbd1Q9Z2E2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mbd1Q9Z2E2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Mbd1Q9Z2E2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mbd1Q9Z2E2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mbd1Q9Z2E2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mbd1Q9Z2E2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mbd1Q9Z2E2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mbd1Q9Z2E2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mbd1Q9Z2E2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mbd1Q9Z2E2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mbd1Q9Z2E2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mbd1Q9Z2E2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mbd1Q9Z2E2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mbd1Q9Z2E2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mbd1Q9Z2E2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mbd1Q9Z2E2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mbd1Q9Z2E2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mbd1Q9Z2E2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mbd1Q9Z2E2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mbd1Q9Z2E2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mbd1Q9Z2E2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mbd1Q9Z2E2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mbd1Q9Z2E2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mbd1Q9Z2E2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mbd1Q9Z2E2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mbd1Q9Z2E2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mbd1Q9Z2E2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mbd1Q9Z2E2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mbd1Q9Z2E2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mbd1Q9Z2E2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mbd1Q9Z2E2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mbd1Q9Z2E2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mbd1Q9Z2E2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mbd1Q9Z2E2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mbd1Q9Z2E2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mbd1Q9Z2E2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mbd1Q9Z2E2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mbd1Q9Z2E2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mbd1Q9Z2E2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mbd1Q9Z2E2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mbd1Q9Z2E2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mbd1Q9Z2E2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mbd1Q9Z2E2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mbd1Q9Z2E2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mbd1Q9Z2E2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mbd1Q9Z2E2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mbd1Q9Z2E2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mbd1Q9Z2E2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mbd1Q9Z2E2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mbd1Q9Z2E2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mbd1Q9Z2E2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mbd1Q9Z2E2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mbd1Q9Z2E2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mbd1Q9Z2E2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mbd1Q9Z2E2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mbd1Q9Z2E2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mbd1Q9Z2E2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mbd1Q9Z2E2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mbd1Q9Z2E2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mbd1Q9Z2E2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mbd1Q9Z2E2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Mbd1Q9Z2E2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mbd1Q9Z2E2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mbd1Q9Z2E2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mbd1Q9Z2E2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms