Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cldn8Q9Z260 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cldn8Q9Z260 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn8Q9Z260 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn8Q9Z260 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn8Q9Z260 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn8Q9Z260 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn8Q9Z260 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn8Q9Z260 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn8Q9Z260 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn8Q9Z260 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn8Q9Z260 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn8Q9Z260 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn8Q9Z260 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn8Q9Z260 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn8Q9Z260 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn8Q9Z260 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn8Q9Z260 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn8Q9Z260 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn8Q9Z260 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn8Q9Z260 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn8Q9Z260 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn8Q9Z260 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn8Q9Z260 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn8Q9Z260 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn8Q9Z260 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn8Q9Z260 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn8Q9Z260 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn8Q9Z260 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn8Q9Z260 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn8Q9Z260 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn8Q9Z260 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn8Q9Z260 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn8Q9Z260 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn8Q9Z260 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cldn8Q9Z260 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn8Q9Z260 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn8Q9Z260 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn8Q9Z260 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn8Q9Z260 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn8Q9Z260 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn8Q9Z260 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn8Q9Z260 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn8Q9Z260 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn8Q9Z260 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn8Q9Z260 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn8Q9Z260 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn8Q9Z260 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn8Q9Z260 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn8Q9Z260 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn8Q9Z260 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn8Q9Z260 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn8Q9Z260 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn8Q9Z260 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn8Q9Z260 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn8Q9Z260 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn8Q9Z260 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn8Q9Z260 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn8Q9Z260 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn8Q9Z260 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn8Q9Z260 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn8Q9Z260 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn8Q9Z260 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn8Q9Z260 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn8Q9Z260 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cldn8Q9Z260 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn8Q9Z260 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn8Q9Z260 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn8Q9Z260 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn8Q9Z260 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn8Q9Z260 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn8Q9Z260 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn8Q9Z260 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn8Q9Z260 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn8Q9Z260 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn8Q9Z260 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn8Q9Z260 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn8Q9Z260 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn8Q9Z260 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn8Q9Z260 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn8Q9Z260 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn8Q9Z260 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn8Q9Z260 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn8Q9Z260 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn8Q9Z260 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn8Q9Z260 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn8Q9Z260 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn8Q9Z260 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn8Q9Z260 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn8Q9Z260 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn8Q9Z260 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn8Q9Z260 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn8Q9Z260 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn8Q9Z260 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn8Q9Z260 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn8Q9Z260 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn8Q9Z260 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn8Q9Z260 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn8Q9Z260 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn8Q9Z260 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms