Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uso1Q9Z1Z0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uso1Q9Z1Z0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uso1Q9Z1Z0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uso1Q9Z1Z0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uso1Q9Z1Z0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uso1Q9Z1Z0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Uso1Q9Z1Z0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uso1Q9Z1Z0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uso1Q9Z1Z0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uso1Q9Z1Z0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uso1Q9Z1Z0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Uso1Q9Z1Z0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Uso1Q9Z1Z0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Uso1Q9Z1Z0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Uso1Q9Z1Z0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Uso1Q9Z1Z0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Uso1Q9Z1Z0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Uso1Q9Z1Z0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Uso1Q9Z1Z0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Uso1Q9Z1Z0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Uso1Q9Z1Z0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Uso1Q9Z1Z0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Uso1Q9Z1Z0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Uso1Q9Z1Z0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Uso1Q9Z1Z0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Uso1Q9Z1Z0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Uso1Q9Z1Z0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Uso1Q9Z1Z0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uso1Q9Z1Z0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uso1Q9Z1Z0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uso1Q9Z1Z0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uso1Q9Z1Z0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uso1Q9Z1Z0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uso1Q9Z1Z0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Uso1Q9Z1Z0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Uso1Q9Z1Z0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Uso1Q9Z1Z0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Uso1Q9Z1Z0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Uso1Q9Z1Z0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Uso1Q9Z1Z0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Uso1Q9Z1Z0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Uso1Q9Z1Z0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Uso1Q9Z1Z0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Uso1Q9Z1Z0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Uso1Q9Z1Z0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Uso1Q9Z1Z0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Uso1Q9Z1Z0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Uso1Q9Z1Z0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Uso1Q9Z1Z0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Uso1Q9Z1Z0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Uso1Q9Z1Z0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Uso1Q9Z1Z0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Uso1Q9Z1Z0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Uso1Q9Z1Z0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Uso1Q9Z1Z0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Uso1Q9Z1Z0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Uso1Q9Z1Z0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Uso1Q9Z1Z0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Uso1Q9Z1Z0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Uso1Q9Z1Z0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Uso1Q9Z1Z0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Uso1Q9Z1Z0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Uso1Q9Z1Z0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Uso1Q9Z1Z0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Uso1Q9Z1Z0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Uso1Q9Z1Z0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Uso1Q9Z1Z0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Uso1Q9Z1Z0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Uso1Q9Z1Z0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Uso1Q9Z1Z0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Uso1Q9Z1Z0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Uso1Q9Z1Z0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Uso1Q9Z1Z0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Uso1Q9Z1Z0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Uso1Q9Z1Z0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Uso1Q9Z1Z0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Uso1Q9Z1Z0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Uso1Q9Z1Z0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Uso1Q9Z1Z0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Uso1Q9Z1Z0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Uso1Q9Z1Z0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Uso1Q9Z1Z0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Uso1Q9Z1Z0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Uso1Q9Z1Z0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Uso1Q9Z1Z0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Uso1Q9Z1Z0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Uso1Q9Z1Z0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Uso1Q9Z1Z0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Uso1Q9Z1Z0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Uso1Q9Z1Z0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Uso1Q9Z1Z0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Uso1Q9Z1Z0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Uso1Q9Z1Z0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Uso1Q9Z1Z0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Uso1Q9Z1Z0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Uso1Q9Z1Z0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Uso1Q9Z1Z0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Uso1Q9Z1Z0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Uso1Q9Z1Z0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms